تصمیم گیری و قضاوت در مناسبت‌ترین ترکیب ساختار سرمایه شرکتها با هدف بیشینه سازی ثروت سهامداران ازجمله موضوعات بسیار مهم در حوزه مدیریت مالی است. بر همین اساس، اطلاع از هزینه سرمایه همواره در تصمیمات شرکتی نقش اساسی داشته است. دستیابی به نرخ هزینه مناسب در تعیین ترکیب بهینه ساختار سرمایه شرکتها و به ویژه در کسب بهترین نتایج حاصل از عملیات به شکل سودآوری، افزایش قیمت سهام و افزایش سرمایه فکری شرکت- ها از اهمیت خاصی برخوردار می‌باشد. بنابراین هدف پژوهش حاضر بررسی تاثیر ساختار سرمایه در سرمایه فکری شرکت ها است. تعداد واحدهای تشکیل دهنده جامعه آماری شامل 30 شرکت پذیرفته شده در صنعت مواد ومحصولات دارویی بورس اوراق بهادار تهران طی سالهای 1384 الی 1391 است. برای محاسبه سرمایه فکری از روش بازده دارایی‌ها و برای محاسبه ساختار سرمایه از نسبت بدهی‌های کوتاه مدت به جمع دارایی‌ها، نسبت بدهی‌های بلندمدت به جمع دارایی‌ها و نسبت حقوق صاحبان سهام به جمع دارایی‌ها استفاده شده است. نتایج نشان می‌دهد که بین نسبت بدهی‌های کوتاه مدت به جمع دارایی‌ها و سرمایه فکری رابطه منفی و معنی‌دار وجود دارد؛ همچنین بین نسبت حقوق صاحبان سهام به جمع دارایی‌ها و سرمایه فکری رابطه مثبت و معنی‌داری وجود دارد.